蛋白層析柱的柱效測定是在純化實驗中非常重要的步驟，也是我們得到準確結果的保證。如果您是自己裝柱，建議您在使用前先做柱效測定來確定柱子的效果。另外，當層析柱使用過一定次數，或者發生實驗結果異常，柱子進入氣泡，超壓等問題，我們也可以對柱子進行柱效測定來判斷柱效是否正常。
即使用少量的樣品流經裝填好的層析柱中，通過儀器上的檢測器檢測實驗過程，實驗結束后對洗脫峰進行分析。凝膠層析用來分離大小不同的蛋白，分子量小的通過凝膠顆粒中的孔隙路徑相對較長，分子量大的通過顆粒間隙路徑相對短些。同樣的時間，路徑短的，流的快的就先出，從而達到分離的目的。
簡單的比喻，兩人賽跑，一步之內很難分勝負，但是五十米，或者一百米就可以分出先后，所以柱子長短關乎分離效果。其它層析如離子交換層析(親和層析)是靠跟配基結合能力強弱(特異性結合)，來達到純化作用，裝柱的長短關系著柱載量，所以柱的長短由你的你的樣品量來決定。
為了得到純度高、特異性好的抗大豆球蛋白多克隆抗體，用溴化氫活化的瓊脂糖4B純化經硫酸銨分級沉淀后的抗體，此免疫親和層析過程節省時間且操作簡單。經凝膠過濾層析的大豆球蛋白，溶脹后的填料與大豆球蛋白配基以共價鍵的形式連接，利用抗原抗體特異性結合的特點，雜蛋白隨流動相流出，再利用洗脫液將抗大豆球蛋白的目標抗體特異性地洗脫下來，用紫外檢測儀檢測非特異性洗脫峰和特異性洗脫峰。
通過鑒定，多抗血清中的其它蛋白組分被非特異性洗脫掉，經濃度測定，特異性洗脫的蛋白質量濃度為0.3mg/mL，間接ELISA顯示，純化后血清稀釋128倍后顯示為陽性。間接競爭ELISA測定抗體特異性結果顯示抗體特異性得到提高。抗體被成功純化，為加工破壞大豆球蛋白致敏性亞分子結構定位奠定基礎，從而促進低致敏性食品的研發。
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